Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R3

Pnpt1, Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpt1Q8K1R3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpt1Q8K1R3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpt1Q8K1R3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpt1Q8K1R3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpt1Q8K1R3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpt1Q8K1R3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpt1Q8K1R3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnpt1Q8K1R3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnpt1Q8K1R3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnpt1Q8K1R3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnpt1Q8K1R3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnpt1Q8K1R3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnpt1Q8K1R3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnpt1Q8K1R3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnpt1Q8K1R3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnpt1Q8K1R3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnpt1Q8K1R3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpt1Q8K1R3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms