Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms