Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TwnkQ8CIW5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TwnkQ8CIW5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TwnkQ8CIW5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TwnkQ8CIW5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TwnkQ8CIW5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TwnkQ8CIW5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TwnkQ8CIW5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TwnkQ8CIW5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TwnkQ8CIW5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TwnkQ8CIW5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TwnkQ8CIW5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms