Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms