Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms