Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Slfn5Q8CBA2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Slfn5Q8CBA2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slfn5Q8CBA2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slfn5Q8CBA2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slfn5Q8CBA2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slfn5Q8CBA2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slfn5Q8CBA2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms