Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A430089I19RikQ8C9W1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms