Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Usp20Q8C6M1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Usp20Q8C6M1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Usp20Q8C6M1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Usp20Q8C6M1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Usp20Q8C6M1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp20Q8C6M1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp20Q8C6M1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp20Q8C6M1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp20Q8C6M1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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