Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Col6a6Q8C6K9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Col6a6Q8C6K9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Col6a6Q8C6K9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Col6a6Q8C6K9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Col6a6Q8C6K9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Col6a6Q8C6K9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Col6a6Q8C6K9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Col6a6Q8C6K9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Col6a6Q8C6K9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Col6a6Q8C6K9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Col6a6Q8C6K9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Col6a6Q8C6K9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col6a6Q8C6K9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Col6a6Q8C6K9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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