Protein–RNA interactions for Protein: Q8C601

BC049762, BC049762 protein, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC049762Q8C601 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC049762Q8C601 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms