Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccdc187Q8C5V8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc187Q8C5V8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc187Q8C5V8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc187Q8C5V8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc187Q8C5V8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc187Q8C5V8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc187Q8C5V8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc187Q8C5V8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc187Q8C5V8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc187Q8C5V8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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