Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp38Q8BW70 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Usp38Q8BW70 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Usp38Q8BW70 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Usp38Q8BW70 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms