Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Zfp398Q8BV16 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Zfp398Q8BV16 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Zfp398Q8BV16 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Zfp398Q8BV16 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Zfp398Q8BV16 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Zfp398Q8BV16 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Zfp398Q8BV16 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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