Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp43Q8BUM9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp43Q8BUM9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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