Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnpy4Q8BQ47 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms