Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms