Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Smarcal1Q8BJL0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Smarcal1Q8BJL0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Smarcal1Q8BJL0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Smarcal1Q8BJL0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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