Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms