Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms