Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cracr2bQ80ZJ8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cracr2bQ80ZJ8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms