Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS9

Stkld1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stkld1Q80YS9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stkld1Q80YS9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stkld1Q80YS9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stkld1Q80YS9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stkld1Q80YS9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stkld1Q80YS9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stkld1Q80YS9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stkld1Q80YS9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stkld1Q80YS9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stkld1Q80YS9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms