Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npm2Q80W85 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npm2Q80W85 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms