Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ell3Q80VR2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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