Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms