Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms