Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms