Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms