Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf139Q7TMV1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms