Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms