Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Sys1Q78S06 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Sys1Q78S06 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Sys1Q78S06 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Sys1Q78S06 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sys1Q78S06 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sys1Q78S06 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sys1Q78S06 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sys1Q78S06 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sys1Q78S06 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Sys1Q78S06 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Sys1Q78S06 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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