Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms