Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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