Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp8b3Q6UQ17 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms