Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timd4Q6U7R4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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