Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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