Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms