Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc3bQ6NWW9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms