Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms