Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ParpbpQ6IRT3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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