Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt40Q6IFX3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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