Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sv2cQ69ZS6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms