Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn4Q69Z26 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms