Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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