Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd5Q68ED3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms