Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2bQ64511 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms