Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcg1Q64343 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcg1Q64343 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcg1Q64343 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcg1Q64343 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcg1Q64343 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcg1Q64343 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcg1Q64343 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcg1Q64343 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcg1Q64343 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcg1Q64343 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcg1Q64343 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcg1Q64343 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcg1Q64343 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcg1Q64343 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcg1Q64343 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcg1Q64343 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Abcg1Q64343 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Abcg1Q64343 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Abcg1Q64343 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Abcg1Q64343 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Abcg1Q64343 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Abcg1Q64343 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Abcg1Q64343 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Abcg1Q64343 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Abcg1Q64343 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Abcg1Q64343 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Abcg1Q64343 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Abcg1Q64343 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcg1Q64343 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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