Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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