Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a5Q63ZW6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a5Q63ZW6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms