Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vat1Q62465 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms