Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5dQ62240 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms